# GEO

许可证声明：未声明（NOASSERTION）；本站处理：待确认，暂只链接原出处。第二遍复核：redistribution: looser by the source's own words (looser-explicit): 原文明示对分发不设限制（no restrictions on the ... distribution），再分发被明确涉及且为许可；提交者权利主张为丙类不降级。按原文应为 yes；比拟定更宽，交采纳环节决定。。

- 能否商用：不明 · 能否改编：不明 · 能否再分发：是 · Mdexa 提供文件：否
- 许可证状态：未声明 (NOASSERTION)
- Mdexa 处理：待确认 — 许可证状态：未声明，按公开规则判定并经第二遍模型复核。许可问题仍未解决。
- 最近核实：2026-11-14
- 信息卡：https://mdexa.com/zh/datasets/geo/

## 关键事实

- 领域：基因与组学
- 内容类型：结构化数据库
- 规模：—
- 语言：英文
- 模态：文本
- 发布方：NCBI
- 年份：—

## GEO 是否允许商业使用

- 商业使用：不明（未声明）。
- 许可状态：未声明。
结论仅记录来源所述，不构成法律意见。

## GEO 许可证证据

官方条款说可免费使用，但未说明能否商用或再分发：未声明，条款在场（第 24 条）部分提交者可能对其提交的数据主张专利、版权或其他权利：使用前核对例外。

- **使用条款页**：在快照 s04（terms-page）中找到的声明 — "Therefore, NCBI places no restrictions on the use or distribution of the GEO data." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **使用条款页**：在快照 s04（terms-page）中找到的声明 — "However, some submitters may claim patent, copyright, or other intellectual property rights in all or a portion of the data they have submitted." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **使用条款页**：在快照 s04（terms-page）中找到的声明 — "NCBI is not in a position to assess the validity of such claims, and therefore cannot provide comment or unrestricted permission concerning the use, copying, or distribution of the information contained in GEO." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **使用条款页**：在快照 s04（terms-page）中找到的声明 — "Unless otherwise stated, documents and files on NCBI Web servers may be freely downloaded and reproduced." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **使用条款页**：在快照 s04（terms-page）中找到的声明 — "However, some material on this site, such as abstracts, may be copyright protected under the U.S. and foreign copyright laws." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **使用条款页**：在快照 s04（terms-page）中找到的声明 — "For such material, the submitting authors or publishers retain all rights for reproduction or redistribution." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **使用条款页**：在快照 s04（terms-page）中找到的声明 — "Permission to reproduce these documents may be required." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **使用条款页**：在快照 s04（terms-page）中找到的声明 — "All persons reproducing, redistributing, or making commercial use of this information are expected to adhere to the terms and conditions asserted by the copyright holder." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **数据集页面**：在快照 s07（page）中找到的声明 — "All GEO records and raw data files are freely available for bulk download from our FTP site." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/download.html (2026-11-13; 亲自打开)
- **数据集页面**：在快照 s07（page）中找到的声明 — "All GEO DataSet records are freely available for bulk download from our FTP site." — https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/download.html (2026-11-13; 亲自打开)

## 来源与血缘

—

## GEO 已知问题

- 由于超时错误，部分父目录已无法通过网页浏览器访问。
- NCBI无法独立核实所提交数据的有效性、质量或生物学意义。

## 预检

未预检（数据未入库）。

## GEO 下载、接口与获取方式

Mdexa 站内不提供文件。原始出处：
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html

### 取用配方

- GEO FTP site (root, all GEO DataSet records) · ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
- GSE1000 matrix directory (example target directory for Series GSE1000) · ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE1nnn/GSE1000/matrix/
- 接口 Construct a URL (GEO accession query)：`https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=gpl96&targ=self&view=brief&form=text` · 示例 `https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=gpl96&targ=self&view=brief&form=text`

## GEO 引用格式

原始资料没有给出推荐引用文本。

## 机器可读

- JSON: https://mdexa.com/datasets/geo.json
- 2026-11-14 部分提交者可能对其提交的数据主张专利、版权或其他权利：使用前核对例外。
- 2026-11-14 2026-11-14 上架。按公开规则判定，经二次核对后收录。两遍判定不一致，卡上取较严的读法：第二遍复核：redistribution: looser by the source's own words (looser-explicit): 原文明示对分发不设限制（no restrictions on the ... distribution），再分发被明确涉及且为许可；提交者权利主张为丙类不降级。按原文应为 yes；比拟定更宽，交采纳环节决定。

## 实用信息

### 内容范围

- GEO 数据库旨在为科学界提供并鼓励获取最新、最全面的基因表达和杂交阵列数据。
  > The GEO database is designed to provide and encourage access within the scientific community to the most up to date and comprehensive gene expression and hybridization array data.
  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13)
- GEO 网站上的信息基于科学界提交的数据。
  > The information presented on the GEO web site is based on data submitted by the scientific community.
  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13)

### 标识符

- 有效的 GEO 登录号形式为 gplxxx、gsmxxx 或 gsexxx。
  > acc = a valid GEO accession i.e., gplxxx, gsmxxx or gsexxx
  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/download.html (2026-11-13)

### 取用方式

- 批量下载：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/download.html
- 批量下载：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/download.html

### 已知缺陷与常见误用

- Huang 等指出样本来源、性别、实验条件等元素在 GEO 与 SRA 中常缺失或记录不一致。
  > For instance, studies have shown that metadata elements such as sample source, sex, or experimental condition are often missing or inconsistently reported in public repositories like GEO and SRA, limiting reusability [ 1 , 14 ].
  https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12421755/ (2026-11-14)

### 适合的任务

- 提供工具和功能以促进数据挖掘和高级查询，旨在帮助识别感兴趣的观察结果。
  > Tools and features are provided to facilitate mining and advanced queries, with the aim to assist identification of observations of interest.
  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/info/disclaimer.html (2026-11-13)

### 尚无有出处的说明

最新版本, 更新周期, 破坏性变更, 不适合的任务, 商业授权入口

## 在本库继续查找

本条目是 109 条已处理并核实的记录之一（数据集、数据资源与开源模型）。查找其他条目：调用 `https://mcp.mdexa.com/v1/datasets?q=<关键词>`，或连接 MCP 服务 `https://mcp.mdexa.com/mcp`；每分钟 20 次以内无需密钥。每行返回不到 1 KB；空结果即"数据库未收录"。核对一份清单：一次批量核对（免费账号）即返回报告。说明：/agents.md。相似条目：AlphaFold Protein Structure Database (https://mdexa.com/zh/datasets/alphafold-db/)；gnomAD (https://mdexa.com/zh/datasets/gnomad/)；ClinPGx/PharmGKB (https://mdexa.com/zh/datasets/pharmgkb/)。