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模型8

许可证状态与本站处理分开记录全部数据集

UniProt

Mdexa 已核实 · 依据公开的判定规则，逐条对照来源原文核实。了解核查方法

能否商用
是
能否改编
是
能否再分发
是
Mdexa 提供文件
否只链接

针对数据的声明允许商用和再分发

宽松只链接CC-BY-4.0收藏

徽章

Mdexa 核实 · 宽松 · 2026-11Mdexa 核实宽松 · 2026-11

[![Mdexa verified · Permissive · 2026-11](https://mcp.mdexa.com/v1/badge/datasets/uniprot.svg)](https://mdexa.com/datasets/uniprot/)

可放置于代码仓库或数据集页面；状态与日期随核实结果更新。 说明

引用本页Mdexa, UniProt, https://mdexa.com/zh/datasets/uniprot/, 核实于 2026-11-13.

关键事实

领域
基因与组学 现代医学
内容
结构化数据库UniProt（通用蛋白质资源）是一个全面的蛋白质信息目录。
规模
—原文：154,222,205 entries
语言 / 模态
英文 / 文本
发布方
UniProt Consortium
年份
2026_04
专家审核
—
核实等级
部分核实

UniProt 是否允许商业使用

商业使用：是。 许可状态为宽松。

条件
署名
第三方权利
来源提示部分内容可能受第三方权利约束。

原文与出处见 UniProt 许可证证据。

结论仅记录来源所述，不构成法律意见。

实用信息

内容范围

取用方式

版本

  • 最新所宣布的 UniProt 知识库（UniProtKB）版本为 2026_04 版，日期为 2026 年 11 月 4 日。
    ftp.uniprot.org ·
    is pleased to announce UniProt Knowledgebase (UniProtKB) Release 2026_04 (04-Nov-2026).

    https://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/relnotes.txt · release-notes · 核实于 2026-11-13

  • 破坏性变更UniProt 在 2025 年 NAR 论文中宣布拟将未审阅（TrEMBL）条目限于参考蛋白质组，预计未审阅条目数先下降；被排除的序列仍保留在 UniParc。
    pmc.ncbi.nlm.nih.gov ·
    It is our intention in 2025 to limit the unreviewed sequences in UniProtKB/TrEMBL to only those derived from reference proteomes

    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11701636/ · peer-reviewed-paper · 核实于 2026-11-13

  • 破坏性变更此前自 2015_04 版起已执行蛋白质组去冗余，删去冗余蛋白质组中的蛋白。
    rest.uniprot.org ·
    Methods to reduce proteome redundancy have been in effect since release 2015_04.

    https://rest.uniprot.org/help/proteome_redundancy · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

  • 破坏性变更UniRef 聚类规则在 2013 年变更：此前没有 80% 覆盖度阈值，旧簇内长度差异更大。
    rest.uniprot.org ·
    Prior to 2013 there was no overlap threshold, so clusters were more heterogeneous in length.

    https://rest.uniprot.org/help/uniref · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

已知缺陷与常见误用

  • Schnoes 等发现：在 37 个酶家族中 Swiss-Prot 多数家族误注释接近 0%，而 TrEMBL、GenBank NR、KEGG 在六个超家族中平均误注释为 5%–63%。
    pmc.ncbi.nlm.nih.gov ·
    the two other protein sequence databases (GenBank NR and TrEMBL) and the protein sequences in the KEGG pathways database exhibit similar and surprisingly high levels of misannotation that average 5%–63% across the six superfamilies studied.

    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2781113/ · peer-reviewed-paper · 核实于 2026-11-13

  • UniProt 说明 TrEMBL 条目由自动系统计算注释，不同于经人工审阅的 Swiss-Prot。
    pmc.ncbi.nlm.nih.gov ·
    In the latter, entries are computationally annotated by automated systems.

    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11701636/ · peer-reviewed-paper · 核实于 2026-11-13

适合的任务

  • UniProt 推荐用 UniRef90/UniRef50 做相似性检索：在保留序列空间完整覆盖的同时降低冗余（体积约减少 58% 与 79%）。
    rest.uniprot.org ·
    UniRef, especially UniRef90 and UniRef50, decreases sequence redundancy compared to UniProtKB and UniParc, while maintaining complete coverage of the sequence space.

    https://rest.uniprot.org/help/uniref_blast_use · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

UniProt 许可证证据 3

  1. 使用条款页亲自打开
    CC-BY-4.0
    第三方原文 · 使用条款页We have chosen to apply the Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0) License to all copyrightable parts of our databases.

    在快照 s10（terms-page）中找到的声明

    uniprot.org2026-11-13 · s10
  2. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页We cannot provide unrestricted permission regarding the use of the data, as some data may be covered by patents or other rights.

    在快照 s10（terms-page）中找到的声明

    uniprot.org2026-11-13 · s10
  3. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页Any medical or genetic information is provided for research, educational and informational purposes only.

    在快照 s10（terms-page）中找到的声明

    uniprot.org2026-11-13 · s10

来源与血缘

没有记录上下游数据集。

UniProt 已知问题

  • 发布方声明不对数据正确性作任何担保，并拒绝承担因使用数据造成的损害责任。
  • 许可帮助页快照仅显示通用回退提示，未包含许可正文。

预检

未预检 数据未入库，预检只对入库数据运行，不代表质量好坏。

UniProt 下载、接口与获取方式

Mdexa 不提供文件，原因见结论。到原始出处获取，使用前请再确认条款：

最新版本 2026_04 · 2026-11-04 · 12 个文件

UniProt 引用格式

Mdexa, UniProt, https://mdexa.com/zh/datasets/uniprot/, 核实于 2026-11-13.
更多引用信息

原始资料没有给出推荐引用文本，上面是本信息卡的引用。

机器可读

uniprot.jsonuniprot.mdcatalog.json

修改记录 8
2026-11-14补入来自所引来源（论文、发布说明、官方页面）的已知缺陷、版本说明与取用方式，每条标明出自谁、何时、来源类型。
2026-11-14实用卡字段（内容范围、标识符、取用方式、版本、已知缺陷）由自动流水线根据已存快照添加，每条陈述带逐字引文。
2026-11-14补入来自所引来源（论文、发布说明、官方页面）的已知缺陷、版本说明与取用方式，每条标明出自谁、何时、来源类型。
2026-11-14补入来自所引来源（论文、发布说明、官方页面）的已知缺陷、版本说明与取用方式，每条标明出自谁、何时、来源类型。
2026-11-14补入来自所引来源（论文、发布说明、官方页面）的已知缺陷、版本说明与取用方式，每条标明出自谁、何时、来源类型。
2026-11-14补入来自所引来源（论文、发布说明、官方页面）的已知缺陷、版本说明与取用方式，每条标明出自谁、何时、来源类型。
2026-11-14补入来自所引来源（论文、发布说明、官方页面）的已知缺陷、版本说明与取用方式，每条标明出自谁、何时、来源类型。
2026-11-132026-11-13 上架。按公开规则判定，经二次核对后收录。 以下页面未能取到：UniProt FTP 知识库 README 与 UniRef README（连接超时），以及 API 与下载帮助页（只返回脚本外壳）。结论依据已取到的页面：UniProt 许可页与发布说明。

与 UniProt 相似的数据集

  • AlphaFold Protein Structure DatabaseMdexa 已核实检索知识库带证据引用 宽松只链接 —

    许可证宽松：针对数据的声明允许商用和再分发。来源风险标记：加工自其他数据集、模型生成。只链接原出处。

    基因与组学 · 结构化数据库 · 加工自其他数据集 · 模型生成

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    共同：领域 基因与组学 · 内容 结构化数据库

  • GEOMdexa 已核实检索知识库 未声明待确认 —

    许可证状态：未声明，按公开规则判定并经第二遍模型复核。许可问题仍未解决。

    基因与组学 · 结构化数据库

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    共同：领域 基因与组学 · 内容 结构化数据库

  • gnomADMdexa 已核实检索知识库 宽松只链接 —

    许可证状态：宽松，按公开规则判定并经第二遍模型复核。仅链接。

    基因与组学 · 结构化数据库

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  • GTExMdexa 已核实 未声明待确认 —

    许可证状态：未声明，按公开规则判定并经第二遍模型复核。许可问题仍未解决。

    基因与组学 · 结构化数据库 · 真实患者文本

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    共同：领域 基因与组学 · 内容 结构化数据库

  • HERB中药高通量实验与文献数据库Mdexa 已核实中药与方剂 无法核实待确认 7,263 条

    许可证无法核实：数据库条款页未能打开，未找到数据许可；确认前只链接原出处。

    中药 · 基因与组学 · 药学与药物 · 结构化数据库

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    共同：领域 基因与组学 · 内容 结构化数据库

尚无有出处的说明

更新周期、不适合的任务、商业授权入口