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许可证状态与本站处理分开记录全部数据集

STRING

Mdexa 已核实 · 依据公开的判定规则，逐条对照来源原文核实。了解核查方法

能否商用
是
能否改编
是
能否再分发
是
Mdexa 提供文件
否只链接

各部分均宽松，条件取各部分的并集STRING 收录或显示的其他资源的材料仍受其原提供方条款约束：使用前核对例外。

宽松只链接CC-BY-4.0收藏

徽章

Mdexa 核实 · 宽松 · 2026-11Mdexa 核实宽松 · 2026-11

[![Mdexa verified · Permissive · 2026-11](https://mcp.mdexa.com/v1/badge/datasets/string.svg)](https://mdexa.com/datasets/string/)

可放置于代码仓库或数据集页面；状态与日期随核实结果更新。 说明

引用本页Mdexa, STRING, https://mdexa.com/zh/datasets/string/, 核实于 2026-11-14.

关键事实

领域
基因与组学 现代医学
内容
结构化数据库STRING数据库12.5版（自2026年9月29日为当前版本）包含来自12535个物种的59'309'604个蛋白质和28'464'487'749项相互作用，依据CC BY 4.0许可提供。
规模
—原文：59'309'604 proteins from 12535 organisms
语言 / 模态
英文 / 表格 · 图谱
发布方
STRING Consortium
年份
September 29, 2026
专家审核
—
核实等级
已核实：看到许可证文字

STRING 是否允许商业使用

商业使用：是。 整体结论取各部分中最严的一项；各部分许可不同，见下列。许可状态为宽松。

条件
署名
第三方权利
来源提示部分内容可能受第三方权利约束。
许可部分
主体数据 — 宽松 (NOASSERTION)
许可部分
STRING data and download files — 宽松 (CC-BY-4.0)

原文与出处见 STRING 许可证证据。

结论仅记录来源所述，不构成法律意见。

实用信息

内容范围

  • 页面列出 12.5 版自 2026 年 9 月 29 日起为当前版本，包含来自 12,535 个物种的 59,309,604 个蛋白质和 28,464,487,749 个相互作用。
    string-db.org ·
    12.5 current: since September 29, 2026 https://string-db.org/ 59'309'604 proteins from 12535 organisms; 28'464'487'749 interactions.

    https://string-db.org/cgi/access · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

  • 12.5 版的条目列出 28,464,487,749 个相互作用。
    string-db.org ·
    12.5 current: since September 29, 2026 https://string-db.org/ 59'309'604 proteins from 12535 organisms; 28'464'487'749 interactions.

    https://string-db.org/cgi/access · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

  • 页面询问 STRING 从哪些数据库提取实验数据，并列出 BIND、DIP、GRID、HPRD、IntAct、MINT 和 PID。
    string-db.org ·
    Which databases does STRING extract experimental data from? Top &#x2191 BIND, DIP, GRID, HPRD, IntAct, MINT, and PID.

    https://string-db.org/help/faq/ · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

  • 页面询问 STRING 从哪些数据库提取人工整理的数据，并列出 Biocarta、BioCyc、GO、KEGG 和 Reactome。
    string-db.org ·
    From which databases does STRING extract curated data? Top &#x2191 Biocarta, BioCyc, GO, KEGG, and Reactome.

    https://string-db.org/help/faq/ · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

标识符

  • STRING identifier常见蛋白质名称、同义词和 UniProt 标识符被映射为 STRING 标识符。
    string-db.org ·
    Maps common protein names, synonyms and UniProt identifiers into STRING identifiers

    https://string-db.org/help/api/ · api-doc · 核实于 2026-11-13

  • → UniProt页面说明可以使用常见基因名称、同义词或 UniProt 标识符和登录号调用 STRING API。
    string-db.org ·
    You can call the STRING API using common gene names, synonyms, or UniProt identifiers and accession numbers.

    https://string-db.org/help/api/ · api-doc · 核实于 2026-11-13

  • → NCBI Taxonomy文本说明 species 是 NCBI/STRING 分类群标识符，例如人类为 9606。
    string-db.org ·
    species is the NCBI/STRING taxon identifier, for example 9606 for human

    https://string-db.org/help/api/ · api-doc · 核实于 2026-11-13

取用方式

  • 网页接口string-db.org tsv · tsv-no-header · json · xml · png · svg

    条款同本卡许可。

    • 页面说明部分 API 方法在每次查询中只允许有限数量的蛋白质。
      string-db.org ·
      some API methods will allow only a limited number of proteins in each query.

      https://string-db.org/help/api/ · api-doc · 核实于 2026-11-13

    • 页面说明若未指定生物体，API 会拒绝大于 10 个蛋白质的网络查询。
      string-db.org ·
      In fact, the API will reject queries for networks larger than 10 proteins without the specified organism.

      https://string-db.org/help/api/ · api-doc · 核实于 2026-11-13

    • 页面要求用户在每次调用之间等待一秒，以免服务器过载。
      string-db.org ·
      Please be considerate and wait one second between each call, so that our server won't get overloaded.

      https://string-db.org/help/api/ · api-doc · 核实于 2026-11-13

  • 仅网页界面string-db.org

    条款同本卡许可。

  • 仅网页界面string-db.org

    条款同本卡许可。

版本

  • 最新页面列出 12.5 版自 2026 年 9 月 29 日起为当前版本。
    string-db.org ·
    12.5 current: since September 29, 2026

    https://string-db.org/cgi/access · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

已知缺陷与常见误用

  • 页面指出 STRING 可能无法始终正确解释原始输入，从而导致错误或不一致的结果。
    string-db.org ·
    Note: STRING may not always interpret the original inputs correctly, which can lead to errors or inconsistent results.

    https://string-db.org/help/api/ · api-doc · 核实于 2026-11-13

  • Blumenthal 等报告：PPI 检测中的研究偏倚与技术偏倚足以产生观察到的幂律度分布；文中把 STRING 列为研究者常用的聚合 PPI 数据库之一。
    pmc.ncbi.nlm.nih.gov ·
    Our findings are supported by mathematical models and extensive simulations, and indicate that study bias and technical bias suffice to produce the observed PL distribution.

    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11718653/ · peer-reviewed-paper · 核实于 2026-11-14

适合的任务

  • 页面说明 STRING 输出可用于 AI 应用，例如 MCP 服务器、检索增强生成、知识图谱和代理工具，以及用于训练或评估机器学习模型。
    string-db.org ·
    STRING outputs may be used in AI applications, such as MCP servers, retrieval-augmented generation (RAG), knowledge graphs and agent tools, and for training or evaluating machine learning models.

    https://string-db.org/cgi/access · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

  • 页面说明发布上述 STRING 输出无需单独许可。
    string-db.org ·
    No separate permission is needed to publish the STRING outputs listed above.

    https://string-db.org/cgi/access · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

  • 页面说明该许可允许以任何媒介和格式（印刷或数字）使用所列输出，涵盖开放获取（CC BY）和订阅期刊、书籍、论文和演示文稿，并包括商业使用。
    string-db.org ·
    The license allows their use in any medium and format, print or digital: in open access (CC BY) and subscription journals, books, theses and presentations, including commercial use.

    https://string-db.org/cgi/access · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

不适合的任务

  • 页面指引需要更大量数据的用户（例如人类的所有相互作用）改用下载页面。
    string-db.org ·
    If you need larger amounts of data (such as for example all interactions in Homo sapiens), please use the Download page instead - which is also more efficient.

    https://string-db.org/cgi/access · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

  • 页面说明 Cytoscape 后端 API 目前尚无文档，其用途不超出 Cytoscape App。
    string-db.org ·
    To make this work, a separate API serves the data to the corresponding 'App' (plugin) in Cytoscape. At present, this API is not yet documented, and we do not recommend it to be used for anything else than the Cytoscape App.

    https://string-db.org/cgi/access · 数据集页面 · 核实于 2026-11-13

标签

适用用途
评测

第三方原文摘录STRING outputs may be used in AI applications, such as MCP servers, retrieval-augmented generation (RAG), knowledge graphs and agent tools, and for training or evaluating machine learning models.快照 s02

检索知识库
来源类型
知识库生成

作者声明据内容推断人工确认

STRING 许可证证据 14

  1. 使用条款页亲自打开
    CC-BY-4.0
    第三方原文 · 使用条款页All data and download files in STRING are freely available under the Creative Commons Attribution 4.0 (CC BY 4.0) license.

    在快照 s02（page）中找到的声明

    string-db.org2026-11-13 · s02
  2. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页When using the data, please credit STRING and indicate any changes or additions you made to the data.

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    string-db.org2026-11-13 · s02
  3. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页The license covers the following STRING outputs, whether obtained from the website, the APIs or the download files: network images, functional enrichment graphs, tables, data files, individual scores and data points, and screenshots of the STRING website.

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    string-db.org2026-11-13 · s02
  1. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页Material from other resources that STRING incorporates or displays remains subject to the terms of its original provider.

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    第三方原文 · 使用条款页No separate permission is needed to publish the STRING outputs listed above.

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    string-db.org2026-11-13 · s02
  3. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页The license allows their use in any medium and format, print or digital: in open access (CC BY) and subscription journals, books, theses and presentations, including commercial use.

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  4. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页The only condition is attribution: please cite STRING (see References ) and indicate if you modified the material.

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    第三方原文 · 使用条款页STRING outputs may be used in AI applications, such as MCP servers, retrieval-augmented generation (RAG), knowledge graphs and agent tools, and for training or evaluating machine learning models.

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  6. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页Derived files, such as indexes, may also be redistributed given clear attribution to STRING.

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  7. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页Please name STRING and its version as the source in the metadata that accompanies the data, so that an agent can tell where the data came from and cite and link to STRING in its answers.

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  8. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页For trained models, please credit STRING and its version in the model or dataset documentation.

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    string-db.org2026-11-13 · s02
  9. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页The STRING name and logo may be reproduced without modification to identify STRING as a data source or tool, for example in figures, workflow or pipeline diagrams and presentations, as long as this does not suggest endorsement by the STRING Consortium.

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    string-db.org2026-11-13 · s02
  10. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页Please bear in mind that this mechanism should only be used for limited or occasional database access, in order to avoid overloading the server.

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    string-db.org2026-11-13 · s02
  11. 使用条款页亲自打开
    第三方原文 · 使用条款页Please do not scrape the HTML page content.

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    string-db.org2026-11-13 · s02

来源与血缘

没有记录上下游数据集。

STRING 已知问题

—

预检

未预检 数据未入库，预检只对入库数据运行，不代表质量好坏。

STRING 下载、接口与获取方式

Mdexa 不提供文件，原因见结论。到原始出处获取，使用前请再确认条款：

最新版本 12.5 · 2026-09-29

STRING 引用格式

Mdexa, STRING, https://mdexa.com/zh/datasets/string/, 核实于 2026-11-14.
更多引用信息

原始资料没有给出推荐引用文本，上面是本信息卡的引用。

机器可读

string.jsonstring.mdcatalog.json

修改记录 2
2026-11-14STRING 收录或显示的其他资源的材料仍受其原提供方条款约束：使用前核对例外。
2026-11-142026-11-14 上架。按公开规则判定，经二次核对后收录。两遍判定不一致，卡上取较严的读法：第二遍复核：license_status: looser by the source's own words (looser-explicit): 【标准许可误作自定义条款】条款页明写全部数据与下载文件采用 CC BY 4.0，并明说可用于商业用途、可用于 AI 训练、衍生文件可再分发。快照中没有甲类句："其他来源的材料仍受原提供方条款约束"属丙类（设 third_party_rights_notice，不降级，第23条），"请勿抓取 HTML""限量访问"属乙类行为义务。按原文应为 permissive（标识 CC-BY-4.0，而非 LicenseRef-STRING-Consortium-terms）；比拟定更宽，按第25条只在原文明示许可时放宽，此处原文明示，交采纳环节放宽，脚本不会自动放宽。；commercial_use: looser by the source's own words (looser-explicit): 原文明示 "including commercial use"，唯一条件是署名（乙类）。署名不使商用变成 conditional，按原文应为 yes；比拟定更宽，交采纳环节决定。

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尚无有出处的说明

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